不一样。两者结构和功能不一样。
谐波保护器是为用电设备提供多功能谐波保护。对用电设备产生的随机高次谐波和高频噪声、脉冲尖峰、电涌等干扰具有抑制和吸收作用；随时跟踪电压波形,瞬时滤除电源中的尖峰、浪涌（雷电）、杂波，矫正因谐波影响而产生畸变的电压波形；对噪声进行消化吸收，使电网电源波形变得光滑清洁，既提高了电网质量，又保证了用电设备的正常运行。
微机消谐装置是放在放在PT的二次侧（所以也叫二次消谐）消除铁磁谐振的仪器。它与一次消谐器的区别在于微机消谐是一个消谐仪器，具有分析、记录、打印、上传等优势，但也有只能用于室内、消谐范围窄（只能消除工频、三倍频、二分频、三分频等指定频率谐振）等缺点。